記者從近日舉辦的“千種海洋生物基因測序項(xiàng)目”暨全球海洋微生物基因庫建設(shè)及應(yīng)用成果聯(lián)合發(fā)布會(huì)上獲悉,華大生命科學(xué)研究院聯(lián)合山東大學(xué)、英國東安格利亞大學(xué)等機(jī)構(gòu),構(gòu)建了迄今為止最完整的海洋微生物基因數(shù)據(jù)庫,并從中發(fā)現(xiàn)大量具有應(yīng)用潛力的基因資源。該研究為開發(fā)抗菌肽、新型基因編輯工具、PET塑料降解酶等提供了新思路。相關(guān)成果在線發(fā)表于國際學(xué)術(shù)期刊《自然》上。
研究團(tuán)隊(duì)介紹,他們通過對已公開的海洋微生物宏基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析和深度挖掘,構(gòu)建了海洋微生物基因數(shù)據(jù)庫GOMC。這一數(shù)據(jù)庫擁有超4.31萬個(gè)海洋微生物基因組和24.58億個(gè)基因序列,是已報(bào)道海洋基因組數(shù)據(jù)庫Tara Ocean的3倍。其中,2萬多個(gè)微生物是潛在新發(fā)現(xiàn)物種,近1萬個(gè)微生物為在深海等獨(dú)特生境中首次發(fā)現(xiàn)。目前,該數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)已存儲(chǔ)于國家基因庫生命大數(shù)據(jù)平臺(tái)。
論文通訊作者、青島華大基因研究院院長范廣益介紹,研究團(tuán)隊(duì)通過對數(shù)據(jù)庫GOMC進(jìn)行深度挖掘,發(fā)現(xiàn)了多項(xiàng)具有應(yīng)用潛力的基因資源。其中,研究團(tuán)隊(duì)鑒定了36個(gè)新型CRISPR-Cas9基因編輯系統(tǒng),并挖掘出一個(gè)具有潛在應(yīng)用價(jià)值的新型Cas9編輯系統(tǒng),為科研人員基因編輯工具使用提供了更多選擇。
據(jù)了解,作為青島自貿(mào)片區(qū)“千種海洋生物基因測序項(xiàng)目”第一年度重要成果,該項(xiàng)研究將助力海洋微生物的演化、生態(tài)學(xué)研究和遺傳資源開發(fā)與利用。
(記者宋迎迎 羅云鵬)
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